Séminaire à l’EPT : Comprendre et modéliser les épidémies grâce aux données génétiques

Date : 16 décembre 2025
Heure : 12h30
Lieu : Auditorium de l’École Polytechnique de Thiès (EPT)

Intervenant :
Samuel Alizon, Directeur de Recherche au Collège de France

Résumé :
Le suivi et l’analyse de la propagation des maladies infectieuses se font classiquement via le nombre de nouveaux cas par unité de temps dans un lieu donné. Cependant, ces informations sont limitées et nécessitent souvent d’être complétées par d’autres types de données obtenues sur les infections individuelles ou les chaînes de transmission sur le terrain.

Les génomes viraux, c’est-à-dire leurs séquences ADN ou ARN, fournissent des informations précieuses aux épidémiologistes, même lorsque seule une faible proportion de l’épidémie est échantillonnée. L’analyse de ces séquences a donné naissance à la phylodynamique, qui étudie comment la propagation des virus et autres microbes laisse des traces dans leur génome.

Le séminaire présentera des études clés illustrant les déductions possibles grâce aux modèles mathématiques et statistiques appliqués aux données génétiques. Les défis futurs pour améliorer la surveillance et la compréhension des épidémies virales seront également abordés.